L'origine de l'église est très ancienne; on en trouve des traces dès le VIIe siècle. Elle était en effet connue sous le nom d'"église des Milanais", car l'église d'origine était dédiée à Ambroise, évêque de Milan, qui s'était réfugié à Gênes en fuyant le sac de la ville par le roi lombard Alboin.

La basilique a ensuite été entièrement reconstruite par les Jésuites à la fin du XVIe siècle. Elle a été conçue par l'architecte et peintre jésuite Giuseppe Valeriano, également auteur de l'église du Gesù Nuovo à Naples.

La façade actuelle, revêtue de pierre de Finale et de marbre, date de 1894, tandis que le clocher date du début du XXe siècle.

L'intérieur de l'église, entièrement recouvert de précieux marbres polychromes, est un exemple prestigieux du baroque génois. Au XVIIe siècle, les voûtes ont été peintes à fresque par les frères Carlone et, à la même époque, les familles nobles génoises ont commandé des retables à de grands artistes européens.

Sur l'autel principal se trouve la Circoncision de Pieter Paul Rubens (1605), qui devait avoir une grande influence sur les peintres locaux en raison de son utilisation de la lumière et d'une nouvelle idée du mouvement.

Dans la nef de gauche se trouve le retable de Saint Ignace guérissant une femme obsédée, également de Rubens, et dans la nef de droite l'Assomption de Guido Reni.

 Il ne faut pas non plus manquer les peintures et les fresques de nombreux peintres importants de l'école génoise et d'ailleurs. Parmi eux: Domenico Piola, Domenico Fiasella, Valerio et Bernardo Castello, Giovanni Andrea et Lorenzo De Ferrari, Domenico Scorticone, Andrea Pozzo et Simon Vouet.